キリスト教を教育の根幹とする西南学院は、教育理念として「真理を探求し、平和を創り出す人間の育成」を掲げています。平和は、自分自身との平和、他者との平和、世界の平和として具体化されます。また神との平和を基盤とすることによって深められ、真理を探求することによって解明されます。平和な未来を創り出す子どもたち、これが私たちの願いです。

礼拝を通して、生命を尊重し、人を愛する心を養い、平和と自由を求める心を育てていきます。西南の森やビオトープで自然を学び、地球環境を考え、生き物と触れ合います。さらに体育や食育を通して健康を考えていきます。「いじめや差別をしない」という消極的な生き方から一歩進んだ生き方として、「自分にして欲しいと思うことを隣人にしてあげる」という積極的な生き方ができるように、日々の学びを充実させます。